Avioni Jugoslovenskog aerotransporta saobraćali su krajem osamdesetih godina na više od 300 linija, od kojih su dve trećine bile međunarodne. U godinama rekorda, 1987/88/89, JAT je povezivao Jugoslaviju sa 61 destinacijom sveta na pet kontinenata, prevozeći godišnje 5 miliona putnika i 46 hiljada tona robe. U tom periodu JAT se visoko kotirao na lestvici najvećih avioprevoznika IATA-e i AEA, među 31 u svetu i 10 u Evropi.

Početkom devedesetih godina sledi najteži period u posleratnoj istoriji bivše Jugoslavije - rat, raspad zemlje i sankcije koje su se prvo i najteže odražavale upravo na nacionalnog avioprevozioca. Ubrzo posle početnih tragičnih dešavanja Jat se vratio na tržište i počeo da hvata korak sa svetom. Već 1994. obnovio je destinacije i krenuo u novu epohu svog razvoja, označenu borbom za opstanak na svetskom nebu. Svake godine rezultati su bili sve bolji, da bi 2006. godine Jat Airways prevezao 1.207.712 putnika, 3556 tona robe i 689 tona pošte i prvi put posle 1991. pozitivno završio poslovnu godinu, sa neto dobitkom od 3,8 miliona evra. Takvi poslovni rezultati daleko su od onih kakve Jat želi da postigne u narednom periodu, ali pokazuju tendenciju permanentnog rasta i to u izuzetno teškom periodu za aviosaobraćaj.

Međunarodna asocijacija za vazdušni saobraćaj (IATA) u februaru 2005. dodelila je Jat Airwaysu IOSA sertifikat, čime je potvrdila da je Jat dostigao, održava i unapređuje najviše vazduhoplovne standarde u domenu bezbednosti vazdušnog saobraćaja i tehničkog održavanja. U decembru 2006. godine sertifikat je obnovljen, čime je srpski nacionalni prevozilac postao prva aviokompanija u svetu koja je obe kontrole prošla bez ijedne neusaglašenosti sa bilo kojim od 800 strogih međunarodnih standarda koje IATA propisuje. Sertifikat je najznačajniji za putnike jer potvrđuje da Jat spada među najbezbednije kompanije.

Najviši stepen bezbednosti, fleksibilna politika cena izražena širokom lepezom promotivnih tarifa, visoki nivo usluge i borba za nova tržišta, najbolji su izraz zahvalnosti nacionalne kompanije za razumevanje i podršku njenim vernim putnicima. Zbog čvrstog opredeljenja da stalno poboljšava usluge koju nudi svojim putnicima, Jat Airways uvodi rezervacije i prodaju karata putem interneta. Cilj ovog projekta je podizanje kvaliteta usluge, uz racionalizaciju poslovanja, što je u skladu sa strateškim ciljevima kompanije. Jat je bio prvo javno preduzeće koje je započelo program restruktuiranja, što je neophodan uslov za vlasničku transformaciju, od koje Jat očekuje obnovu flote i povratak na nekadašnje pozicije jednog od najboljih evropskih avioprevozilaca. Realizacija tog strateškog cilja započela je u godini jubileja, u kojoj Jat proslavlja svoj 60. rođendan i osam decenija uspostavljanja civilnog vazdušnog saobraćaja u Srbiji.