Le prédécesseur de la Jat Airways, la Société de transport aérien Aeroput, a été fondé le 17 juin 1927. Cette date marque aussi le commencement de l’aviation civile dans notre pays. Vingt ans plus tard, le 1er avril 1947, ont décollé, sur les premières lignes d'après-guerre des avions sous le nom de l’entreprise "Jugoslovenski Aerotransport".

A la mi-janvier 1947, l'Administration du transport aérien civil est passée sous la responsabilité du Ministère du transport et c'est ainsi que son statut civil a été confirmé. Le 17 mars, des pilotes, des navigateurs, des opérateurs radio et des mécaniciens d’aviation tout juste démobilisés ont été transférés du Régiment militaire de transport vers l’entreprise nouvellement créée. Entre-temps, l’entreprise a acquis des avions adaptés et donc, il est désormais devenu possible de déterminer la date de départ de la première saison de vols. Elle a été lancée le 1er avril 1947.

Dans les rangs de la Jat se sont vite retrouvés les pilotes et mécaniciens de l' "Aeroput" qui ont rejoint, après avoir traversé les tempêtes de la guerre, "Jugoslovenski Aerotransport " lors de sa fondation ou à ses tout débuts.

"Jugoslovenski Aerotransport" a commencé son activité avec deux avions C-47 transformés en DC-3 et deux JU-52 Junkers. Au cours de la première année, la flotte s'est agrandie d' un autre JU-52, de quatre DC-3 et d'un C-47 non adapté, prévu pour le transport des marchandises. Ces avions assuraient le transport régulier sur les lignes domestiques Belgrade-Zagreb-Ljubljana, Zagreb-Sarajevo, ainsi que sur la ligne internationale Belgrade-Prague-Varsovie.

En 1963 trois avions Caravelles ont rejoint la flotte de la Jat. Six ans plus tard la flotte a été encore agrandie d'un premier Douglas DC-9, et sept ans plus tard de son premier Boeing 707. En même temps, les derniers moteurs vétérans DC-3 et Convairi ont été retirés de la flotte. L'introduction dans le trafic aérien de jets et d'avions de plus grandes capacités d'accueil ainsi que de vol et par dessus beaucoup plus confortables, économiques et, en toutes catégories supérieurs a l'ancienne génération d'avions, constitue la base de l’expansion du réseau aérien et de la conquête de nouveaux marchés. Cela a principalement donné le ton au développement de "Jugoslovenski Aerotransport" jusqu’au début des années soixante-dix, une période qui sera appelée au sein de la compagnie le "début de l'aviation jet".

Si le début des années soixante a été marqué par l’introduction des premiers avions jets, les années soixante-dix ont été importantes du fait de l’intègrement dans la flotte du "grand bœing" B-707. Les premières lignes charters ayant toutes les caractéristiques du trafic régulier ont ensuite été établies vers l'Amérique du Nord. L'introduction en 1978 du Douglas DC-10-30, le premier avion au corps large, marque le début d’une des étapes les plus importantes dans le développement de la JAT.

L’investissement permanent dans la modernisation de sa flotte et l’acquisition du DC-10-30 ont mené "Jugoslovenski Aerotransport" vers une phase nouvelle dans son développement, soi-disant appelée la phase "large-corps". Quelques années plus tard JAT a été une des premières entreprises en Europe à acheter des avions moyens courriers B-737, ce qui a créé les conditions préalables élémentaires pour le développement du trafic vers presque toutes les directions prévues. Ainsi, les lignes actuelles vers l'Europe, le Moyen Orient, l'Afrique, ont sensiblement été élargies et l’expansion du réseau des lignes vers l'Amérique, le Canada et l'Australie, a suivie.

Pendant ces années "d'or", comme certains chroniqueurs ont appelé cette période, Jat a ouvert plusieurs agences dans le monde, a transporté cinq millions de passagers par an, a développé et modernisé ses opérations techniques, en parallèle avec le développement des activités tierces, comme l’aviation économique, l’hôtellerie, les centres de formation et l’investissement dans le développement de son infrastructure. Jat a aussi construit un grand hangar pour les avions au corps large. Tous cela a permis à l’entreprise de maîtriser les techniques de maintenance des moteurs et des autres composants de la flotte moderne. En outre la sompagnie s’est avérée excellente dans la connaissance des affaires en négociant efficacement des contrats avec plusieurs entreprises du tiers monde. Jat a développé son système d'informations et a introduit dans son offre la vente automatique de billets. En bref, l’entreprise a tenté de faire face à la compétition en répondant aux demandes et aux attentes croissantes des passagers. En même temps elle n’a pas cessé de satisfaire ses passagers réguliers pour enfin, un jour, finalement voir son fameux slogan devenir réalité - JAT c'est PLUS QUE VOLER .

Jugoslovenski Aerotransport a changé de nom et est devenu Jat Airways le 8 août 2003.